Le territoire de Plaine et Vallées de Niort est une zone où des dégradations sont observées à la fois sur le compartiment « eau » et sur celui de la « biodiversité » : pressions azotées, pressions des pesticides, pertes d’habitats. Plusieurs projets se développent sur le territoire pour reconquérir et préserver la qualité de l’eau et des milieux. Un des axes de travail consiste à diminuer ces pressions de pollution et de dégradation, en partie d’origine agricole, notamment via le développement et la promotion de l’agriculture biologique.